更快,更便宜的测试可以帮助预测前列腺癌患者
作者:admin 日期:2020-09-07 浏览:
对于新诊断为前列腺癌的男性或先前接受过治疗的患者,转移的风险是选择保守治疗还是接受进一步治疗的关键决定因素。对于前列腺癌和其他癌症,原发性肿瘤的生长或扩散是由基因组部分的扩增或缺失驱动的。杂志上的一份报告介绍了一种评估CNA的新方法,该方法比其他诊断技术更便宜,更快,可重现且所需的组织更少,并且具有显着增强前列腺癌评估的潜力。
转移发生在大约16%的前列腺癌中,占所有男性癌症死亡的8%。在诊断时进行准确的预测可以确定有转移风险的男性,这些男性将从积极治疗中受益。前列腺组织或血液中CNA的检测可提供先前诊断的疾病是否已进展的指示。扩增和缺失的基因代表了用于治疗侵袭性前列腺癌的新靶标。
我们已经证明,使用新的下一代拷贝数变更(NG-CNA)分析可以快速,准确地检测到CNA。此信息的影响有两方面:确保在患有以下疾病的男性确诊时采取积极的治疗措施易发生转移的疾病,并为惰性疾病男性提供了主动监测(而不是过度治疗)的理由。
NG-CNA分析是一种靶向扩增测序技术,能够分析属于194个基因组区域的902个基因组位点。与阵列比较基因组杂交阵列(CGH)相比,NG-CNA可以更快地处理样品并降低每个样品的成本。博士说:“例如,使用NG-CNA,DNA提取,文库制备和测序试剂的成本为每个样品20至40美元,而全基因组测序的成本接近1000美元。”
实际上,像NG-CNA分析一样,大规模多重分析可以以个性化的方式进入个性化医学应用,而成本仅为传统的全基因组测序方法的一小部分。
蚌埠男科医院指出NG-CNA的另一个实用优势是比全基因组测序更容易破译结果。新的分析方法允许一次运行处理数百至数千个样品,典型的周转时间为36小时。与全基因组测序相比,使用NG-CNA分析评估的样品还需要更少的数据存储。博士补充说:“这使我们的方法可以根据需要从大型参考实验室转变为规模更小,资源更多的独立实验室。”
NG-CNA分析的另一个好处是,与其他技术相比,它可以处理更少量的材料(低至12.5 ng),从而可以分析细胞系,手术样品和活检样品。CNA方法还提供了一个平台,可以将其他测序测试(例如伴随诊断测试)整合到该平台上。
在以前的工作中,研究人员使用其他测量技术的数据,开发了转移潜力评分(MPS)作为转移潜力的指标。他们发现MPS可以高度预测前列腺癌,三阴性乳腺癌和肺腺癌转移。在当前的研究中,NG-CNA分析数据用于计算70例临床结果已知的前列腺癌外科研究样品中的MPS,并且该结果与Oncoscan CNV分析的结果高度相关。在一个单独的组中,在手术样品和仅在NG-CNA平台上进行的匹配活检之间发现了临床和分析有效性。MPS阈值0.99表示来自低危肿瘤的高危。
博士说:“我们认为,将NG-CNA分析法添加到标准的癌症基因测试平台上,将通过识别攻击性肿瘤和基因突变来预测靶向治疗的反应,从而增强个性化医学。”
转移发生在大约16%的前列腺癌中,占所有男性癌症死亡的8%。在诊断时进行准确的预测可以确定有转移风险的男性,这些男性将从积极治疗中受益。前列腺组织或血液中CNA的检测可提供先前诊断的疾病是否已进展的指示。扩增和缺失的基因代表了用于治疗侵袭性前列腺癌的新靶标。
我们已经证明,使用新的下一代拷贝数变更(NG-CNA)分析可以快速,准确地检测到CNA。此信息的影响有两方面:确保在患有以下疾病的男性确诊时采取积极的治疗措施易发生转移的疾病,并为惰性疾病男性提供了主动监测(而不是过度治疗)的理由。
NG-CNA分析是一种靶向扩增测序技术,能够分析属于194个基因组区域的902个基因组位点。与阵列比较基因组杂交阵列(CGH)相比,NG-CNA可以更快地处理样品并降低每个样品的成本。博士说:“例如,使用NG-CNA,DNA提取,文库制备和测序试剂的成本为每个样品20至40美元,而全基因组测序的成本接近1000美元。”
实际上,像NG-CNA分析一样,大规模多重分析可以以个性化的方式进入个性化医学应用,而成本仅为传统的全基因组测序方法的一小部分。
蚌埠男科医院指出NG-CNA的另一个实用优势是比全基因组测序更容易破译结果。新的分析方法允许一次运行处理数百至数千个样品,典型的周转时间为36小时。与全基因组测序相比,使用NG-CNA分析评估的样品还需要更少的数据存储。博士补充说:“这使我们的方法可以根据需要从大型参考实验室转变为规模更小,资源更多的独立实验室。”
NG-CNA分析的另一个好处是,与其他技术相比,它可以处理更少量的材料(低至12.5 ng),从而可以分析细胞系,手术样品和活检样品。CNA方法还提供了一个平台,可以将其他测序测试(例如伴随诊断测试)整合到该平台上。
在以前的工作中,研究人员使用其他测量技术的数据,开发了转移潜力评分(MPS)作为转移潜力的指标。他们发现MPS可以高度预测前列腺癌,三阴性乳腺癌和肺腺癌转移。在当前的研究中,NG-CNA分析数据用于计算70例临床结果已知的前列腺癌外科研究样品中的MPS,并且该结果与Oncoscan CNV分析的结果高度相关。在一个单独的组中,在手术样品和仅在NG-CNA平台上进行的匹配活检之间发现了临床和分析有效性。MPS阈值0.99表示来自低危肿瘤的高危。
博士说:“我们认为,将NG-CNA分析法添加到标准的癌症基因测试平台上,将通过识别攻击性肿瘤和基因突变来预测靶向治疗的反应,从而增强个性化医学。”
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